PyArrow:递增地使用ParquetWriter,而无需将整个数据集保存在内存中(大于内存拼接文件)
问题描述
我正在尝试将一个较大的拼图文件写入磁盘(大于内存)。我天真地认为我可以聪明地使用ParquetWriter和WRITE_TABLE递增地写入文件,比如(POC):
import pyarrow as pa
import pyarrow.parquet as pq
import pickle
import time
arrow_schema = pickle.load(open('schema.pickle', 'rb'))
rows_dataframe = pickle.load(open('rows.pickle', 'rb'))
output_file = 'test.parq'
with pq.ParquetWriter(
output_file,
arrow_schema,
compression='snappy',
allow_truncated_timestamps=True,
version='2.0', # Highest available schema
data_page_version='2.0', # Highest available schema
) as writer:
for rows_dataframe in function_that_yields_data()
writer.write_table(
pa.Table.from_pydict(
rows_dataframe,
arrow_schema
)
)
但是,即使I正在生成块(在我的例子中类似于10,000行)并使用write_table
,它仍然将整个数据集保留在内存中。
原来ParquetWriter将整个数据集保留在内存中,同时以增量方式写入磁盘。
有没有什么办法可以强制ParquetWriter不将整个数据集保存在内存中,或者有充分的理由根本不可能这样做?
解决方案
根据Arrow bug report中的分析,这可能是由元数据集合导致的,而元数据集合只能在文件关闭时刷新。
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