如何理解GWAS中Manhattan plot和QQ plot所传递的信息

GWAS（Genome-Wide Association Studies）是一种用于发现遗传学关联的研究方法，其中Manhattan plot和QQ plot是常用的可视化工具，用于传递GWAS研究中关键信息。 Manhattan plot是一种图形，用于检查GWAS研究中的关联性。它将染色体位置沿横轴排列，而将相关性P值沿纵轴排列。在Manhattan plot中，可以清楚地看到哪些位置具有较强的关联性，因为这些位置的P值低于阈值（通常为5×10-8），而位于阈值之上的位置则表示没有显著的关联性。 QQ plot是一种图形，用于检查GWAS研究中的相关性。它将P值沿横轴排列，而将标准正态分布沿纵轴排列。在QQ plot中，可以清楚地看到P值的分布情况，从而判断这些P值是否符合标准正态分布，从而检查GWAS研究中的相关性。 总之，Manhattan plot和QQ plot可以用来传递GWAS研究中的关键信息，Manhattan plot可以检查哪些位置具有较强的关联性，而QQ plot可以检查P值的分布情况，从而检查GWAS研究中的相关性。

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