如何对字符进行2位编码?在Java中
DNA分子由以下四个值之一表示:A、C、G或T。我需要将A、C、G和T中的字符串转换为对每个字符进行编码的字节数组
有两个比特。A比特00,C比特01,G比特10,T比特11。我不知道如何将字符转换为2比特。我试着改变和掩饰,但得到了错误的结果。
在开始时,我检查该行中是否有字符。然后,我将每个字符转换为位值并将其插入到数组中。当我插入ACGT时,我在输出中得到0 1 3 2。在这里我遇到了一个问题,因为我不知道如何将值转换为2位。
Scanner text = new Scanner(System.in);
String str = text.nextLine();
if (str.contains("A") && str.contains("C") && str.contains("G") && str.contains("T")){
System.out.println("");
}
else
{
System.out.println("wrong command format");
}
byte mas[] = str.getBytes();
System.out.println("String in byte array : " + Arrays.toString(mas));
for (int i = 0; i < mas.length; i++){
byte mask = 3;
byte number = mas[i];
byte result = (byte)((number >> 1) & mask);
System.out.println(result);
}
}
}
解决方案
您似乎想要将位保存在一个字节中。下面的例子可能会给出一些启示。
public class Main
{
private static final int A = 0x00; // b00
private static final int C = 0x01; // b01
private static final int G = 0x02; // b10
private static final int T = 0x03; // b11
public static void main(String[] args) throws Exception
{
byte store = 0;
store = setByte(store, 0, A);
store = setByte(store, 1, C);
store = setByte(store, 2, G);
store = setByte(store, 3, T);
System.out.println(Integer.toBinaryString(store));
//11111111111111111111111111100100
System.out.println(getByte(store, 0)); //0
System.out.println(getByte(store, 1)); //1
System.out.println(getByte(store, 2)); //2
System.out.println(getByte(store, 3)); //3
}
//Behavior :: Store "value" into "store".
//Reminder :: Valid index 0 - 3. Valid value 0 - 3.
private static byte setByte(byte store, int index, int value)
{
store = (byte)(store & ~(0x3 << (2 * index)));
return store |= (value & 0x3) << (2 * index);
}
private static byte getByte(byte store, int index)
{
return (byte)((store >> (2 * index)) & 0x3);
}
}
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