使用rdf4j将元组转换为json

2022-03-26 00:00:00 json sparql java rdf4j

问题是这样的:在解析SPARQL查询时,我得到了简化的ast,我需要将它传递给第三方库进行进一步处理,但开箱即用的功能(Rdf4j)不允许以机器可读的格式传输ast,我只想以json格式接收tex。

        StringBuilder qb = new StringBuilder();
        qb.append("    PREFIX has_vaccine_allergen: <http://purl.obolibrary.org/obo/VO_0000531>
" +
                "    PREFIX chicken_egg_protein_allergen: <http://purl.obolibrary.org/obo/VO_0000912>   
" +
                "    SELECT distinct ?vaccine_label ?vaccine 
" +
                "    FROM <http://purl.obolibrary.org/obo/merged/VO>
" +
                "    WHERE {
" +
                "        ?vaccine rdfs:label ?vaccine_label .
" +
                "        ?vaccine rdfs:subClassOf ?vaccine_restriction .
" +
                "        ?vaccine_restriction owl:onProperty has_vaccine_allergen:; owl:someValuesFrom chicken_egg_protein_allergen: .
" +
                "	}");
        SPARQLParser parser = new SPARQLParser();

        ParsedTupleQuery q = (ParsedTupleQuery)parser.parseQuery(qb.toString(), null);
        TupleExpr te = q.getTupleExpr();
        System.out.println(te);

代码执行结果:

SelectQuery
[PrefixDecl (prefix=has_vaccine_allergen), PrefixDecl (prefix=chicken_egg_protein_allergen), SelectQuery]
Distinct
   Projection
      ProjectionElemList
         ProjectionElem "vaccine_label"
         ProjectionElem "vaccine"
      Join
         Join
            Join
               StatementPattern
                  Var (name=vaccine)
                  Var (name=_const_9285ccfc_uri, value=http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#label, anonymous)
                  Var (name=vaccine_label)
               StatementPattern
                  Var (name=vaccine)
                  Var (name=_const_4592be07_uri, value=http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#subClassOf, anonymous)
                  Var (name=vaccine_restriction)
            StatementPattern
               Var (name=vaccine_restriction)
               Var (name=_const_a509c4e0_uri, value=http://www.w3.org/2002/07/owl#onProperty, anonymous)
               Var (name=_const_3319983d_uri, value=http://purl.obolibrary.org/obo/VO_0000531, anonymous)
         StatementPattern
            Var (name=vaccine_restriction)
            Var (name=_const_6539d60c_uri, value=http://www.w3.org/2002/07/owl#someValuesFrom, anonymous)
            Var (name=_const_3319a704_uri, value=http://purl.obolibrary.org/obo/VO_0000912, anonymous)

我需要将其转换为json格式

RDF4J

首先:TupleExpr对象(及其下面的树)不是抽象语法树,而是推荐答案的查询代数模型。如果希望直接处理SPARQL查询的AST,可以使用SyntaxTreeBuilder.parseQuery(queryString)接收实际的AST。也就是说,对AST或代数模型执行查询重新处理可以起作用,这在一定程度上取决于您的输出到底应该做什么,哪一个是最佳选择。

对于AST或查询代数模型,RDF4J具有抽象的Visitor实现,您可以根据自己的需要自由扩展这些实现。对于AST树,AbstractASTVisitor是一个很好的起点(确保您选择了正确的起点,RDF4J有两个:一个用于SeRQL,一个用于SPARQL)。对于查询代数模型,从AbstractQueryModelVisitor开始。在RDF4J代码库本身中有大量实现这两种方法的示例。典型的模式是覆盖要定义自己行为的meet方法,并在处理不是叶的节点时注意在末尾调用super.meet()

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