图数据库 Nebula Graph 的数据模型和系统架构设计

2022-04-18 00:00:00 数据 执行 属性 类型 顶点
Nebula Graph:一个开源的分布式图数据库。作为能够存储万亿个带属性的节点和边的在线图数据库,Nebula Graph 不仅能够在高并发场景下满足毫秒级的低时延查询要求,而且能够提供极高的服务可用性和数据安全性。

本篇主要介绍 Nebula Graph 的数据模型和系统架构设计。

有向属性图 DirectedPropertyGraph

Nebula Graph 采用易理解的有向属性图来建模,也就是说,在逻辑上,图由两种图元素构成:顶点和边。

 

有向属性图

顶点 Vertex

在 Nebula Graph 中顶点由标签 tag 和对应 tag 的属性组构成, tag 代表顶点的类型,属性组代表 tag 拥有的一种或多种属性。一个顶点必须至少有一种类型,即标签,也可以有多种类型。每种标签有一组相对应的属性,我们称之为 schema 。

如上图所示,有两种 tag 顶点:player 和 team。player 的 schema 有三种属性 ID (vid),Name (sting)和 Age (int);team 的 schema 有两种属性 ID (vid)和 Name(string)。

和 Mysql 一样,Nebula Graph 是一种强 schema 的数据库,属性的名称和数据类型都是在数据写入前确定的。

边 Edge

在 Nebula Graph 中边由类型和边属性构成,而 Nebula Graph 中边均是有向边,有向边表明一个顶点( 起点 src )指向另一个顶点( 终点 dst )的关联关系。此外,在 Nebula Graph 中我们将边类型称为 edgetype ,每一条边只有一种 **edgetype** ,每种 edgetype 相应定义了这种边上属性的 schema 。

回到上面的图例,图中有两种类型的边,一种为 player 指向 player 的 like 关系,属性为 likeness (double);另一种为 player 指向 team 的 serve 关系,两个属性分别为 start_year (int) 和 end_year (int)。


Tips:需要说明的是,起点1 和终点2 之间,可以同时存在多条相同或者不同类型的边。

图分割 GraphPartition

由于超大规模关系网络的节点数量高达百亿到千亿,而边的数量更会高达万亿,即使仅存储点和边两者也远大于一般服务器的容量。因此需要有方法将图元素切割,并存储在不同逻辑分片 partition 上。Nebula Graph 采用边分割的方式,默认的分片策略为哈希散列,partition 数量为静态设置并不可更改。

图分割示意图

数据模型 DataModel

在 Nebula Graph 中,每个顶点被建模为一个 key-value ,根据其 vertexID(或简称 vid)哈希散列后,存储到对应的 partition 上。

key-value 示意图

一条逻辑意义上的边,在 Nebula Graph 中将会被建模为两个独立的 key-value ,分别称为 out-key 和 in-key 。out-key 与这条边所对应的起点存储在同一个 partition 上,in-key 与这条边所对应的终点存储在同一个 partition 上。

Out-key & In-key 示意图


关于数据模型的详细设计会在后续的系列文章中介绍。

系统架构 Architecture

Nebula Graph 包括四个主要的功能模块,分别是存储层、元数据服务、计算层和客户端。

Nebula Graph 架构图

存储层 Storage

在 Nebula Graph 中存储层对应进程是 nebula-storaged ,其核心为基于 Raft(用来管理日志复制的一致性算法) 协议的分布式 Key-valueStorage 。
目前支持的主要存储引擎为「Rocksdb」和「HBase」。
Raft 协议通过 leader/follower 的方式,来保持数据之间的一致性。Nebula Storage 主要增加了以下功能和优化:

  1. Parallel Raft:允许多台机器上的相同 partiton-id 组成一个 Raft group 。通过多组 Raft group 实现并发操作。
  2. Write Path & batch:Raft 协议的多机器间同步依赖于日志 id 顺序性,这样的吞吐量 throughput 较低。通过批量和乱序提交的方式可以实现更高的吞吐量。
  3. Learner:基于异步复制的 learner。当集群中增加新的机器时,可以将其先标记为 learner,并异步从 leader/follower 拉取数据。当该 learner 追上 leader 后,再标记为 follower,参与 Raft 协议。
  4. Load-balance:对于部分访问压力较大的机器,将其所服务的 partition 迁移到较冷的机器上,以实现更好的负载均衡。

KV 存储架构图

元数据服务层 Metaservice

Metaservice 对应的进程是 nebula-metad ,其主要的功能有:

  1. 用户管理:Nebula Graph 的用户体系包括 Goduser , Admin , User , Guest 四种。每种用户的操作权限不一。
  2. 集群配置管理:支持上线、下线新的服务器。
  3. 图空间管理:增持增加、删除图空间,修改图空间配置(Raft副本数)
  4. Schema 管理:Nebula Graph 为强 schema 设计。
  5. 通过 Metaservice 记录 Tag 和 Edge 的属性的各字段的类型。支持的类型有:整型 int, 双精度类型 double, 时间数据类型 timestamp, 列表类型 list等;
  6. 多版本管理,支持增加、修改和删除 schema,并记录其版本号
  7. TTL 管理,通过标识到期回收 time-to-live 字段,支持数据的自动删除和空间回收

MetaService 层为有状态的服务,其状态持久化方法与 Storage 层一样通过 KVStore 方式存储。

元数据服务架构图

计算层 Query Engine & Query Language(nGQL)

计算层对应的进程是 nebula-graphd ,它由完全对等无状态无关联的计算节点组成,计算节点之间相互无通信。
Query Engine 层的主要功能,是解析客户端发送 nGQL 文本,通过词法解析 Lexer 和语法解析 Parser 生成执行计划,并通过优化后将执行计划交由执行引擎,执行引擎通过 MetaService 获取图点和边的 schema,并通过存储引擎层获取点和边的数据。
Query Engine 层的主要优化有:

  1. 异步和并发执行:由于 IO 和网络均为长时延操作,需采用异步及并发操作。此外,为避免单个长 query 影响后续 query,Query Engine 为每个 query 设置单独的资源池以保证服务质量 QoS。
  2. 计算下沉:为避免存储层将过多数据回传到计算层占用宝贵的带宽,条件过滤 where 等算子会随查询条件一同下发到存储层节点。
  3. 执行计划优化:虽然在关系数据库 SQL 中执行计划优化已经经历了长时间的发展,但业界对图查询语言的优化研究较少。Nebula Graph 对图查询的执行计划优化进行了一定的探索,包括执行计划缓存和上下文无关语句并发执行。

计算层架构图

客户端 API & Console

Nebula Graph 提供 C++、Java、Golang 三种语言的客户端,与服务器之间的通信方式为 RPC,采用的通信协议为 Facebook-Thrift。用户也可通过 Linux 上 console 实现对 Nebula Graph 操作。Web 访问方式目前在开发过程中。

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