基于Patroni的Citus高可用环境部署
1. 前言
Citus是一个非常实用的能够对PostgreSQL进行水平扩展的解决方案，或者说是一款基于PostgreSQL的分布式HTAP数据库。本文简单说明Citus HA的技术方案，并实际演示一下搭建Citus HA环境的步骤。
2. 技术方案
2.1 Citus HA方案选型
Citus集群由一个CN节点和N个Worker节点组成。CN节点的高可用可以使用任何通用的PG 高可用方案，即为CN节点通过流复制配置主备2台PG机器；Worker节点的高可用除了可以像CN一样采用PG原生的高可用方案，还支持另一种多副本分片的高可用方案。
多副本高可用方案是Citus早期版本默认的worker高可用方案（当时shard_count默认值为2），这种方案部署非常简单，而且坏一个worker节点也不影响业务。在多副本高可用中，每次写入数据时，CN节点需要在2个worker上分别写数据，这也带来一系列不利的地方。
- 数据写入的性能下降
- 对多个副本的数据一致性的保障也没有PG原生的流复制强
- 存在功能上的限制，比如不支持Citus MX架构
因此，Citus的多副本高可用方案适用场景有限，Citus 官方文档上也说可能它只适用于append only的业务场景,不作为推荐的高可用方案了(在Citus 6.1的时候，shard_count默认值从2改成了1)。
因此，建议Citus和CN和Worker节点都使用PG的原生流复制部署高可用。
2.2 PG HA支持工具的选型
PG本身提供的流复制的HA的部署和维护都不算很复杂，但是如果我们追求更高程度的自动化，特别是自动故障切换，可以使用一些使用第3方的HA工具。目前有很多种可选的开源工具，下面几种算是比较常用的
- PAF(PostgreSQL Automatic Failover)
- repmgr
- Patroni
它们的比较可以参考: https://scalegrid.io/blog/managing-high-availability-in-postgresql-part-1/
其中patroni采用DCS存储元数据，能够严格的保障元数据的一致性，可靠性高；而且它的功能也比较强大。
因此个人推荐使用patroni（只有2台机器无法部署etcd的情况可以考虑其它方案）。本文也基于patroni演示Citus高可用的部署。
2.3 客户端流量切换方案
PG 主备切换后，访问数据库的客户端也要相应地连接到新的主库。目前常见的有下面几种方案：
HA Proxy
优点
- 可靠
- 支持负载均衡
缺点
- 性能损耗
- haproxy自身的HA
- 性能损耗
VIP
- 优点
- 无性能损耗，不占用机器资源
- 缺点
- 主备节点IP必须在同网段
- 优点
客户端多主机URL
优点
- 无性能损耗，不占用机器资源
- 不依赖VIP，易于在云环境部署
- pgjdbc支持读写分离和负载均衡
缺点
- 仅部分客户端驱动支持(目前包括pgjdbc，libpq和基于libpq的驱动，如python和php)
- 如果数据库层面没控制好出现了"双主"， 客户端同时向2个主写数据的风险较高
对于Citus集群情况稍有不同，推荐的候选方案如下
- 应用连接Citus
- 客户端多主机URL
- VIP
- Citus CN连接Worker
- VIP
- worker节点发生切换时动态修改Citus CN上的worker节点元数据
在条件许可的情况下，推荐采用客户端多主机URL访问Citus，但考虑到有些开发语言的驱动不支持多主机URL，因此本文演示的方案如下
客户端通过VIP连接Citus CN
- 通过patroni回调动态配置读写VIP
- 通过keepalived配置只读VIP
worker节点发生切换时动态修改Citus CN上的worker节点元数据
3. 实验环境
主要软件
- CentOS 7.8
- PostgreSQL 12
- Citus 10.4
- patroni 1.6.5
- etcd 3.3.25
机器和vip资源
- Citus CN
- node1：192.168.234.201
- node2：192.168.234.202
- Citus Worker
- node3：192.168.234.203
- node4：192.168.234.204
- etcd
- node4：192.168.234.204
- VIP（Citus CN )
- 读写VIP：192.168.234.210
- 只读VIP：192.168.234.211
环境准备
所有节点设置时钟同步
yum install -y ntpdate
ntpdate time.windows.com && hwclock -w
如果使用防火墙需要开放postgres，etcd和patroni的端口。
- postgres:5432
- patroni:8000
- etcd:2379/2380
更简单的做法是将防火墙关闭
setenforce 0
sed -i.bak "s/SELINUX=enforcing/SELINUX=permissive/g" /etc/selinux/config
systemctl disable firewalld.service
systemctl stop firewalld.service
iptables -F
4. etcd部署
因为本文的主题不是etcd的高可用，所以只在node4上部署单节点的etcd用于实验。部署步骤如下
安装需要的包
yum install -y gcc python-devel epel-release
安装etcd
yum install -y etcd
编辑etcd配置文件/etc/etcd/etcd.conf, 参考配置如下
ETCD_DATA_DIR="/var/lib/etcd/default.etcd"
ETCD_LISTEN_PEER_URLS="http://192.168.234.204:2380"
ETCD_LISTEN_CLIENT_URLS="http://localhost:2379,http://192.168.234.204:2379"
ETCD_NAME="etcd0"
ETCD_INITIAL_ADVERTISE_PEER_URLS="http://192.168.234.204:2380"
ETCD_ADVERTISE_CLIENT_URLS="http://192.168.234.204:2379"
ETCD_INITIAL_CLUSTER="etcd0=http://192.168.234.204:2380"
ETCD_INITIAL_CLUSTER_TOKEN="cluster1"
ETCD_INITIAL_CLUSTER_STATE="new"
启动etcd
systemctl start etcd
设置etcd自启动
systemctl enable etcd
5. PostgreSQL + Citus + Patroni HA部署
在需要运行PostgreSQL的实例上安装相关软件
安装PostgreSQL 12和Citus
yum install -y https://download.postgresql.org/pub/repos/yum/reporpms/EL-7-x86_64/pgdg-redhat-repo-latest.noarch.rpm
yum install -y postgresql12-server postgresql12-contrib
yum install -y citus_12
安装patroni
yum install -y gcc epel-release
yum install -y python-pip python-psycopg2 python-devel
pip install --upgrade pip
pip install --upgrade setuptools
pip install patroni[etcd]
创建PostgreSQL数据目录
mkdir -p /pgsql/data
chown postgres:postgres -R /pgsql
chmod -R 700 /pgsql/data
创建partoni service配置文件/etc/systemd/system/patroni.service
[Unit]
Description=Runners to orchestrate a high-availability PostgreSQL
After=syslog.target network.target
[Service]
Type=simple
User=postgres
Group=postgres
ExecStart=/usr/bin/patroni /etc/patroni.yml
KillMode=process
TimeoutSec=30
Restart=no
[Install]
WantedBy=multi-user.targ
创建patroni配置文件/etc/patroni.yml,以下是node1的配置示例
scope: cn
namespace: /service/
name: pg1
restapi:
listen: 0.0.0.0:8000
connect_address: 192.168.234.201:8000
etcd:
host: 192.168.234.204:2379
bootstrap:
dcs:
ttl: 30
loop_wait: 10
retry_timeout: 10
maximum_lag_on_failover: 1048576
master_start_timeout: 300
synchronous_mode: false
postgresql:
use_pg_rewind: true
use_slots: true
parameters:
listen_addresses: "0.0.0.0"
port: 5432
wal_level: logical
hot_standby: "on"
wal_keep_segments: 1000
max_wal_senders: 10
max_replication_slots: 10
wal_log_hints: "on"
max_connections: "100"
max_prepared_transactions: "100"
shared_preload_libraries: "citus"
citus.node_conninfo="sslmode=prefer"
citus.replication_model: streaming
citus.task_assignment_policy: round-robin
initdb:
- encoding: UTF8
- locale: C
- data-checksums
pg_hba:
- host replication repl 0.0.0.0/0 md5
- host all all 0.0.0.0/0 md5
postgresql:
listen: 0.0.0.0:5432
connect_address: 192.168.234.201:5432
data_dir: /pgsql/data
bin_dir: /usr/pgsql-12/bin
authentication:
replication:
username: repl
password: "123456"
superuser:
username: postgres
password: "123456"
tags:
nofailover: false
noloadbalance: false
clonefrom: false
nosync: false
其他PG节点的patroni.yml需要相应修改下面4个参数
- scope
- node1，node2设置为cn
- node3，node4设置为wk1
- name
- node1node4分别设置pg1pg4
- restapi->connect_address
- 根据各自节点IP设置
- postgresql->connect_address
- 根据各自节点IP设置
启动patroni
在所有节点上启动patroni。
systemctl start patroni
同一个cluster中，次启动的patroni实例会作为leader运行，并初始创建PostgreSQL实例和用户。后续节点初次启动时从leader节点克隆数据
查看cn集群状态
[root@node1 ~]# patronictl -c /etc/patroni.yml list
+ Cluster: cn (6869267831456178056) +---------+----+-----------+-----------------+
| Member | Host | Role | State | TL | Lag in MB | Pending restart |
+--------+-----------------+--------+---------+----+-----------+-----------------+
| pg1 | 192.168.234.201 | | running | 1 | 0.0 | * |
| pg2 | 192.168.234.202 | Leader | running | 1 | | |
+--------+-----------------+--------+---------+----+-----------+-----------------+
查看wk1集群状态
[root@node3 ~]# patronictl -c /etc/patroni.yml list
+ Cluster: wk1 (6869267726994446390) ---------+----+-----------+-----------------+
| Member | Host | Role | State | TL | Lag in MB | Pending restart |
+--------+-----------------+--------+---------+----+-----------+-----------------+
| pg3 | 192.168.234.203 | | running | 1 | 0.0 | * |
| pg4 | 192.168.234.204 | Leader | running | 1 | | |
+--------+-----------------+--------+---------+----+-----------+-----------------+
为了方便日常操作，设置全局环境变量PATRONICTL_CONFIG_FILE
echo 'export PATRONICTL_CONFIG_FILE=/etc/patroni.yml' >/etc/profile.d/patroni.sh
添加以下环境变量到~postgres/.bash_profile，。
export PGDATA=/pgsql/data
export PATH=/usr/pgsql-12/bin:$PATH
设置postgres拥有sudoer权限
echo 'postgres ALL=(ALL) NOPASSWD: ALL'> /etc/sudoers.d/postgres
5. 配置Citus
在cn和wk的主节点上创建citus扩展
create extension citus
在cn的主节点上，添加wk1的主节点IP，groupid设置为1。
SELECT * from master_add_node('192.168.234.204', 5432, 1, 'primary');
在cn的主备节点上，创建~postgres/.pgpass 文件，支持CN免密连接Worker。
#hostname:port:database:username:password
192.168.234.203:5432:postgres:postgres:123456
192.168.234.204:5432:postgres:postgres:123456
创建分片表测试验证
create table tb1(id int primary key,c1 text);
set citus.shard_count = 64;
select create_distributed_table('tb1','id');
6. 配置Worker的自动流量切换
上面配置的Worker IP是当时的Worker主节点IP，在Worker发生主备切换后，这个IP将失效。
因此，需要通过脚本监视worker主备状态，当worker主备角色更新时，自动更新Citus上的worker元数据为新主节点的IP。下面是脚本的参考实现
创建配置文件/pgsql/citus_controller.yml
postgresql:
connect_address: 192.168.234.202:5432
authentication:
superuser:
username: postgres
password: "123456"
citus:
loop_wait: 10
databases:
- postgres
workers:
- groupid: 1
nodes:
- 192.168.234.203:5432
- 192.168.234.204:5432
上面的citus节点也可以添加到’/etc/patroni.yml’里，这样可以共用部分配置。
创建worker流量自动切换脚本/pgsql/citus_controller.py
#!/usr/bin/env python2
# -*- coding: utf-8 -*-
import os
import time
import argparse
import logging
import yaml
import psycopg2
def get_pg_role(url):
result = 'unknow'
try:
with psycopg2.connect(url, connect_timeout=2) as conn:
conn.autocommit = True
cur = conn.cursor()
cur.execute("select pg_is_in_recovery()")
row = cur.fetchone()
if row[0] == True:
result = 'secondary'
elif row[0] == False:
result = 'primary'
except Exception as e:
logging.debug('get_pg_role() failed. url:{0} error:{1}'.format(
url, str(e)))
return result
def update_worker(url, role, groupid, nodename, nodeport):
logging.debug('call update worker. role:{0} groupid:{1} nodename:{2} nodeport:{3}'.format(
role, groupid, nodename, nodeport))
try:
sql = "select nodeid,nodename,nodeport from pg_dist_node where groupid={0} and noderole = '{1}' order by nodeid limit 1".format(
groupid, role)
conn = psycopg2.connect(url, connect_timeout=2)
conn.autocommit = True
cur = conn.cursor()
cur.execute(sql)
row = cur.fetchone()
if row is None:
logging.error("can not found nodeid whose groupid={0} noderole = '{1}'".format(groupid, role))
return False
nodeid = row[0]
oldnodename = row[1]
oldnodeport = str(row[2])
if oldnodename == nodename and oldnodeport == nodeport:
logging.debug('skip for current nodename:nodeport is same')
return False
sql= "select master_update_node({0}, '{1}', {2})".format(nodeid, nodename, nodeport)
ret = cur.execute(sql)
logging.info("Changed worker node {0} from '{1}:{2}' to '{3}:{4}'".format(nodeid, oldnodename, oldnodeport, nodename, nodeport))
return True
except Exception as e:
logging.error('update_worker() failed. role:{0} groupid:{1} nodename:{2} nodeport:{3} error:{4}'.format(
role, groupid, nodename, nodeport, str(e)))
return False
def main():
parser = argparse.ArgumentParser(description='Script to auto setup Citus worker')
parser.add_argument('-c', '--config', default='citus_controller.yml')
parser.add_argument('-d', '--debug', action='store_true', default=False)
args = parser.parse_args()
if args.debug:
logging.basicConfig(format='%(asctime)s %(levelname)s: %(message)s', level=logging.DEBUG)
else:
logging.basicConfig(format='%(asctime)s %(levelname)s: %(message)s', level=logging.INFO)
# read config file
f = open(args.config,'r')
contents = f.read()
config = yaml.load(contents, Loader=yaml.FullLoader)
cn_connect_address = config['postgresql']['connect_address']
username = config['postgresql']['authentication']['superuser']['username']
password = config['postgresql']['authentication']['superuser']['password']
databases = config['citus']['databases']
workers = config['citus']['workers']
dbname = databases[0]
loop_wait = config['citus'].get('loop_wait',10)
logging.info('start main loop')
loop_count = 0
while True:
loop_count += 1
logging.debug("##### main loop start [{}] #####".format(loop_count))
cn_url = "postgres://{0}/{1}?user={2}&password={3}".format(
cn_connect_address,dbname,username,password)
if(get_pg_role(cn_url) == 'primary'):
for worker in workers:
groupid = worker['groupid']
nodes = worker['nodes']
## get role of worker nodes
primarys = []
secondarys = []
for node in nodes:
wk_url = "postgres://{0}/{1}?user={2}&password={3}".format(
node,dbname,username,password)
role = get_pg_role(wk_url)
if role == 'primary':
primarys.append(node)
elif role == 'secondary':
secondarys.append(node)
logging.debug('Role info groupid:{0} primarys:{1} secondarys:{2}'.format(
groupid,primarys,secondarys))
## update worker node
for dbname in databases:
cn_url = "postgres://{0}/{1}?user={2}&password={3}".format(
cn_connect_address,dbname,username,password)
if len(primarys) == 1:
nodename = primarys[0].split(':')[0]
nodeport = primarys[0].split(':')[1]
update_worker(cn_url, 'primary', groupid, nodename, nodeport)
"""
Citus的pg_dist_node元数据中要求nodename:nodeport必须，所以无法同时支持secondary节点的动态更新。
一个可能的回避方法是为每个worker配置2个IP地址，一个作为parimary角色时使用，另一个作为secondary角色时使用。
if len(secondarys) >= 1:
nodename = secondarys[0].split(':')[0]
nodeport = secondarys[0].split(':')[1]
update_worker(cn_url, 'secondary', groupid, nodename, nodeport)
elif len(secondarys) == 0 and len(primarys) == 1:
nodename = primarys[0].split(':')[0]
nodeport = primarys[0].split(':')[1]
update_worker(cn_url, 'secondary', groupid, nodename, nodeport)
"""
time.sleep(loop_wait)
if __name__ == '__main__':
main()
再cn主备节点上都启动worker流量自动切换脚本
su - postgres
cd /pgsql
python citus_controller.py -c citus_controller.yml
7. 读写分离
根据上面的配置，Citus CN不会访问Worker的备机，这些备机闲着也是闲着，能否让Citus CN支持读写分离呢？也就是让CN的备机优先访问Worker的备机，Worker备节故障时访问Worker的主机。
Citus有读写分离功能，可以把一个worker的主备节点作为2个worker项目分别以primary和secondary的角色加入到同一个group里。但是，由于Citus的pg_dist_node元数据中要求nodename:nodeport必须，所以前面的动态修改Citus元数据中的worker IP的方式无法同时支持primary节点和secondary节点的动态更新。
解决办法有2个
方法1：Citus元数据中只写固定的主机名，比如wk1，wk2…，然后通过自定义的worker流量自动切换脚本将这个固定的主机名解析成不同的IP地址写入到/etc/hosts里，也就是在CN主库上解析成Worker主库的IP，在CN备库上解析成Worker备库的IP。
方法2：在Worker上动态绑定读写VIP和只读VIP。在Citus元数据中读写VIP作为primary角色的Worker，只读VIP作为secondary角色的Worker。
patroni动态绑VIP的方法参考基于patroni搭建PostgreSQL HA集群.md
对Citus worker，读写VIP通过callback脚本动态绑定；只读VIP通过keepalived动态绑定。
采用这种方式时，创建Citus集群时，就需要把Worker的VIP加入集群。
在cn的主节点上，添加wk1的读写VIP(192.168.234.210)和只读VIP（192.168.234.211），groupid设置为1。
SELECT * from master_add_node('192.168.234.210', 5432, 1, 'primary');
SELECT * from master_add_node('192.168.234.211', 5432, 1, 'secondary');
在cn的主备节点上，创建~postgres/.pgpass 文件，支持CN免密连接Worker。
#hostname:port:database:username:password
192.168.234.210:5432:postgres:postgres:123456
192.168.234.211:5432:postgres:postgres:123456
为了让CN备库连接到secondary的worker，还需要再CN备库上设置以下参数
alter system set citus.use_secondary_nodes=always;
select pg_reload_conf();
现在分别到CN主库和备库上执行同一条SQL，可以看到SQL被发往不同的worker。
CN主库（未设置citus.use_secondary_nodes=always）：
postgres=# explain select * from tb1;
QUERY PLAN
-------------------------------------------------------------------------------
Custom Scan (Citus Adaptive) (cost=0.00..0.00 rows=100000 width=36)
Task Count: 32
Tasks Shown: One of 32
-> Task
Node: host=192.168.234.210 port=5432 dbname=postgres
-> Seq Scan on tb1_102168 tb1 (cost=0.00..22.70 rows=1270 width=36)
(6 rows)
CN备库（设置了citus.use_secondary_nodes=always）：
postgres=# explain select * from tb1;
QUERY PLAN
-------------------------------------------------------------------------------
Custom Scan (Citus Adaptive) (cost=0.00..0.00 rows=100000 width=36)
Task Count: 32
Tasks Shown: One of 32
-> Task
Node: host=192.168.234.211 port=5432 dbname=postgres
-> Seq Scan on tb1_102168 tb1 (cost=0.00..22.70 rows=1270 width=36)
(6 rows)
由于CN也会发生主备切换，上面这个参数必须动态调节。这可以使用patroni的回调脚本实现
创建动态设置参数的/pgsql/switch_use_secondary_nodes.sh
#!/bin/bash
DBNAME=postgres
action=$1
role=$2
cluster=$3
log()
{
echo "switch_use_secondary_nodes: $*"|logger
}
alter_use_secondary_nodes()
{
value="$1"
psql -d ${DBNAME} -c "alter system set citus.use_secondary_nodes=${value}"
rc=$?
if [ $rc -ne 0 ] ;then
log "fail to alter use_secondary_nodes to '${value}' rc=$rc"
exit 1
fi
psql -d ${DBNAME} -c 'select pg_reload_conf()'
rc=$?
if [ $rc -ne 0 ] ;then
log "fail to call pg_reload_conf() rc=$rc"
exit 1
fi
log "alter use_secondary_nodes to '${value}'"
}
log "switch_use_secondary_nodes start args:'$*'"
case $action in
on_start|on_restart|on_role_change)
case $role in
master)
alter_use_secondary_nodes never
;;
replica)
alter_use_secondary_nodes always
;;
*)
log "wrong role '$role'"
exit 1
;;
esac
;;
*)
log "wrong action '$action'"
exit 1
;;
esac
修改patroni配置文件/etc/patroni.yml，配置回调函数
postgresql:
...
callbacks:
on_start: /bin/bash /pgsql/switch_use_secondary_nodes.sh
on_restart: /bin/bash /pgsql/switch_use_secondary_nodes.sh
on_role_change: /bin/bash /pgsql/switch_use_secondary_nodes.sh
所有节点的patroni配置文件都修改后，重新加载patroni配置
patronictl reload pgsql
cn上执行switchover后，可以看到use_secondary_nodes发生了切换
/var/log/messages:
Sep 7 02:27:17 node1 postgres: switch_use_secondary_nodes: switch_use_secondary_nodes start args:'on_role_change replica cn' Sep 7 02:27:17 node1 patroni: ALTER SYSTEM Sep 7 02:27:17 node1 patroni: pg_reload_conf Sep 7 02:27:17 node1 patroni: ---------------- Sep 7 02:27:17 node1 patroni: t Sep 7 02:27:17 node1 patroni: (1 行记录) Sep 7 02:27:17 node1 postgres: switch_use_secondary_nodes: alter use_secondary_nodes to 'always'登录后复制相关文章